因上夜班导致身体不健康并与单位协商离职，可能会面临一些潜在的法律风险：
1. 单位否认夜班与健康问题的关联性，拒绝协商或补偿。如果你的健康诊断证明中，医生并未明确写明“长期夜班是导致该健康问题的直接原因”，而只是一些如“神经衰弱”、“免疫力低下”等较为笼统的诊断，单位是很可能会以此为由否认夜班与你健康问题的关联性，进而拒绝你的协商补偿要求的。
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因上夜班导致身体不健康，员工是可以主动向单位提出协商离职的。以下从不同情况为你详细说明：
1. 如果单位的夜班安排符合《劳动法》关于工作时间和休息休假的规定（如每日工作不超过8小时，每周不超过44小时，保证每周至少休息一日，加班需与员工协商且每月不超过36小时等），你仍有权提出协商离职，但此时单位无过错，协商离职一般无法获得经济补偿。
2. 如果单位的夜班安排违反了上述劳动法规定，例如长期强制安排超长时间夜班、未保证足够休息时间等，导致你身体不健康，你不仅可以提出协商离职，还可以此为由要求单位支付经济补偿。
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因上夜班导致身体不健康而与单位协商离职，以下特殊情况或例外情形可能会影响处理结果：
1. 劳动合同中明确约定了夜班工作内容：如果你的劳动合同中明确约定了你的工作岗位就是需要长期上夜班，并且你在签订合同时对此是知晓并同意的，那么单位据此安排夜班就具有合同依据。在此情况下，你以夜班导致身体不健康为由提出协商离职并主张经济补偿，难度会相对较大，单位可能会以是你个人身体无法适应合同约定的工作内容为由，拒绝给予额外补偿。
2. 单位已采取合理措施减轻夜班对健康的影响：如果单位在安排夜班时，已经按照法律规定保障了你的休息休假权利（如合理安排轮休、提供必要的劳动保护条件、给予夜班津贴等），并且对于你提出的健康问题，单位也积极采取了如调整班次、建议休病假等合理措施进行改善，那么在协商离职时，单位可能会认为其已尽到应尽义务，从而在经济补偿等方面的协商空间会缩小。
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因上夜班导致身体不健康而与单位协商离职，过程中需避免一些常见的错误操作：
1. 未与单位协商一致前擅自离职：有些员工可能觉得身体不适难以忍受，便不打招呼自行停止上班。这种行为可能被单位视为旷工，甚至可能被追究违约责任，反而对自己不利。应先进行协商，尽量达成一致。
2. 轻易签署空白或不公平的离职文件：单位可能会提供一些格式化的离职文件，如果其中条款对你不公平（如放弃所有权利、不提及健康与夜班的关系等），切勿轻易签署。仔细阅读每一条款，有疑问及时提出，必要时咨询专业人士。
3. 忽视与单位沟通时的录音或书面记录：协商沟通的过程性证据也很重要。如果单位口头承诺了某些条件（如给予一定补偿），但事后反悔，若无证据则难以维权。重要的沟通可以进行录音（需注意合法性），或要求对方出具书面说明。
如果你在协商离职过程中遇到单位推诿、拒绝或提出不合理要求，建议及时向专业律师咨询，以维护自身合法权益。

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